Protein–RNA interactions for Protein: Q3US41

Esrp1, Epithelial splicing regulatory protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esrp1Q3US41 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Esrp1Q3US41 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Esrp1Q3US41 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Esrp1Q3US41 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Esrp1Q3US41 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Esrp1Q3US41 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Esrp1Q3US41 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Esrp1Q3US41 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Esrp1Q3US41 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Esrp1Q3US41 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Esrp1Q3US41 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Esrp1Q3US41 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Esrp1Q3US41 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Esrp1Q3US41 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Esrp1Q3US41 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms