Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf48Q3US17 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf48Q3US17 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf48Q3US17 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf48Q3US17 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf48Q3US17 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf48Q3US17 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf48Q3US17 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf48Q3US17 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf48Q3US17 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Znf48Q3US17 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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