Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl4Q3URY0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtl4Q3URY0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rtl4Q3URY0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtl4Q3URY0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms