Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5460Q3UQ97 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5460Q3UQ97 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5460Q3UQ97 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5460Q3UQ97 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5460Q3UQ97 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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