Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fhdc1Q3ULZ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fhdc1Q3ULZ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fhdc1Q3ULZ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fhdc1Q3ULZ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fhdc1Q3ULZ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fhdc1Q3ULZ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Fhdc1Q3ULZ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fhdc1Q3ULZ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fhdc1Q3ULZ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms