Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc33Q3ULW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc33Q3ULW6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc33Q3ULW6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc33Q3ULW6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms