Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E330014E10RikQ3UL33 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330014E10RikQ3UL33 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330014E10RikQ3UL33 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms