Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc34Q3UI66 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc34Q3UI66 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc34Q3UI66 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc34Q3UI66 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms