Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF7

Hivep2, Transcription factor HIVEP2, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep2Q3UHF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms