Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef1Q3UHC1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef1Q3UHC1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef1Q3UHC1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef1Q3UHC1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef1Q3UHC1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms