Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Plxnd1Q3UH93 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxnd1Q3UH93 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnd1Q3UH93 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnd1Q3UH93 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Plxnd1Q3UH93 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxnd1Q3UH93 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms