Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctu2Q3U308 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu2Q3U308 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctu2Q3U308 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctu2Q3U308 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms