Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec24aQ3U2P1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec24aQ3U2P1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec24aQ3U2P1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec24aQ3U2P1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec24aQ3U2P1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms