Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ89

Sec31b, Protein transport protein Sec31B, mousemouse

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31bQ3TZ89 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec31bQ3TZ89 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31bQ3TZ89 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec31bQ3TZ89 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec31bQ3TZ89 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec31bQ3TZ89 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms