Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfyve27Q3TXX3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfyve27Q3TXX3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfyve27Q3TXX3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms