Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TchpQ3TVW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TchpQ3TVW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TchpQ3TVW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TchpQ3TVW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms