Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiartQ3TQ03 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiartQ3TQ03 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CiartQ3TQ03 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CiartQ3TQ03 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms