Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XylbQ3TNA1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
XylbQ3TNA1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XylbQ3TNA1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
XylbQ3TNA1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms