Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc102aQ3TMW1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms