Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpgp1Q3TLS3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpgp1Q3TLS3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpgp1Q3TLS3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms