Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp39Q3TIX9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp39Q3TIX9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp39Q3TIX9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp39Q3TIX9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms