Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem248Q3TBN1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem248Q3TBN1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem248Q3TBN1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem248Q3TBN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem248Q3TBN1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem248Q3TBN1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem248Q3TBN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem248Q3TBN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem248Q3TBN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem248Q3TBN1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem248Q3TBN1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem248Q3TBN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem248Q3TBN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms