Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr27Q3SYJ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr27Q3SYJ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms