Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHK6

Gsdmc2, Gasdermin-C2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc2Q2KHK6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gsdmc2Q2KHK6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gsdmc2Q2KHK6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gsdmc2Q2KHK6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gsdmc2Q2KHK6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms