Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Shroom4Q1W617 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Shroom4Q1W617 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Shroom4Q1W617 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Shroom4Q1W617 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Shroom4Q1W617 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Shroom4Q1W617 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Shroom4Q1W617 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Shroom4Q1W617 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Shroom4Q1W617 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Shroom4Q1W617 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Shroom4Q1W617 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Shroom4Q1W617 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Shroom4Q1W617 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
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