Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms