Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam171bQ14CH0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam171bQ14CH0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171bQ14CH0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam171bQ14CH0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam171bQ14CH0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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