Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc45a4Q0P5V9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc45a4Q0P5V9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc45a4Q0P5V9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc45a4Q0P5V9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms