Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssrp1Q08943 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ssrp1Q08943 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssrp1Q08943 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssrp1Q08943 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssrp1Q08943 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms