Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff1Q08423 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff1Q08423 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff1Q08423 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms