Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn3Q07409 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn3Q07409 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntn3Q07409 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntn3Q07409 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms