Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdr16c6Q05A13 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdr16c6Q05A13 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr16c6Q05A13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr16c6Q05A13 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms