Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Fmn1Q05860 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Fmn1Q05860 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Fmn1Q05860 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Fmn1Q05860 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Fmn1Q05860 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Fmn1Q05860 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Fmn1Q05860 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Fmn1Q05860 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Fmn1Q05860 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Fmn1Q05860 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Fmn1Q05860 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Fmn1Q05860 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms