Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emx2Q04744 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emx2Q04744 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Emx2Q04744 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emx2Q04744 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emx2Q04744 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms