Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tff2Q03404 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tff2Q03404 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tff2Q03404 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tff2Q03404 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms