Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gjb4Q02738 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjb4Q02738 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb4Q02738 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjb4Q02738 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gjb4Q02738 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms