Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ascl1Q02067 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl1Q02067 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ascl1Q02067 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ascl1Q02067 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms