Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
AlkP97793 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
AlkP97793 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
AlkP97793 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
AlkP97793 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
AlkP97793 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
AlkP97793 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
AlkP97793 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AlkP97793 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
AlkP97793 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AlkP97793 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
AlkP97793 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
AlkP97793 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
AlkP97793 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
AlkP97793 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
AlkP97793 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
AlkP97793 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
AlkP97793 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
AlkP97793 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
AlkP97793 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
AlkP97793 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
AlkP97793 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
AlkP97793 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
AlkP97793 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
AlkP97793 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
AlkP97793 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
AlkP97793 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
AlkP97793 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
AlkP97793 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
AlkP97793 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
AlkP97793 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
AlkP97793 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
AlkP97793 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
AlkP97793 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
AlkP97793 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AlkP97793 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
AlkP97793 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AlkP97793 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AlkP97793 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
AlkP97793 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
AlkP97793 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
AlkP97793 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
AlkP97793 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
AlkP97793 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
AlkP97793 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
AlkP97793 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
AlkP97793 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
AlkP97793 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
AlkP97793 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
AlkP97793 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
AlkP97793 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
AlkP97793 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
AlkP97793 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
AlkP97793 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
AlkP97793 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
AlkP97793 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
AlkP97793 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
AlkP97793 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
AlkP97793 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
AlkP97793 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
AlkP97793 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
AlkP97793 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
AlkP97793 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
AlkP97793 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
AlkP97793 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
AlkP97793 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
AlkP97793 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
AlkP97793 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
AlkP97793 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
AlkP97793 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
AlkP97793 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
AlkP97793 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
AlkP97793 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
AlkP97793 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
AlkP97793 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
AlkP97793 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
AlkP97793 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
AlkP97793 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
AlkP97793 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
AlkP97793 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
AlkP97793 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
AlkP97793 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
AlkP97793 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
AlkP97793 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
AlkP97793 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
AlkP97793 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
AlkP97793 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
AlkP97793 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
AlkP97793 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
AlkP97793 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
AlkP97793 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
AlkP97793 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
AlkP97793 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
AlkP97793 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
AlkP97793 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
AlkP97793 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
AlkP97793 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
AlkP97793 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
AlkP97793 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
AlkP97793 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms