Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra1P97785 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra1P97785 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gfra1P97785 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfra1P97785 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra1P97785 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra1P97785 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms