Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry1P97784 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry1P97784 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cry1P97784 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry1P97784 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry1P97784 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cry1P97784 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cry1P97784 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry1P97784 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry1P97784 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cry1P97784 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry1P97784 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry1P97784 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cry1P97784 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry1P97784 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry1P97784 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms