Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Psme1P97371 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Psme1P97371 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Psme1P97371 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Psme1P97371 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Psme1P97371 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Psme1P97371 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Psme1P97371 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Psme1P97371 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Psme1P97371 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Psme1P97371 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Psme1P97371 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Psme1P97371 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Psme1P97371 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Psme1P97371 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Psme1P97371 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Psme1P97371 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Psme1P97371 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Psme1P97371 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Psme1P97371 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms