Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b3P97370 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp1b3P97370 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp1b3P97370 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Atp1b3P97370 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp1b3P97370 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp1b3P97370 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp1b3P97370 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp1b3P97370 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms