Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx1P81068 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx1P81068 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx1P81068 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx1P81068 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx1P81068 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx1P81068 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx1P81068 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx1P81068 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx1P81068 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx1P81068 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx1P81068 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx1P81068 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx1P81068 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx1P81068 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx1P81068 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx1P81068 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx1P81068 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx1P81068 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx1P81068 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx1P81068 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx1P81068 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx1P81068 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx1P81068 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms