Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp4P70343 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp4P70343 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp4P70343 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casp4P70343 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp4P70343 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp4P70343 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp4P70343 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp4P70343 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp4P70343 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp4P70343 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp4P70343 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp4P70343 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp4P70343 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp4P70343 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp4P70343 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp4P70343 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp4P70343 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp4P70343 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp4P70343 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Casp4P70343 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp4P70343 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms