Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgif1P70284 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif1P70284 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgif1P70284 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif1P70284 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms