Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chl1P70232 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chl1P70232 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chl1P70232 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chl1P70232 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chl1P70232 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chl1P70232 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Chl1P70232 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chl1P70232 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chl1P70232 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Chl1P70232 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Chl1P70232 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Chl1P70232 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chl1P70232 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chl1P70232 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chl1P70232 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chl1P70232 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chl1P70232 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms