Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba4aP68368 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tuba4aP68368 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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