Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps29P62274 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps29P62274 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps29P62274 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps29P62274 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps29P62274 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps29P62274 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps29P62274 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps29P62274 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps29P62274 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps29P62274 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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