Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp46P62069 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp46P62069 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp46P62069 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp46P62069 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp46P62069 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp46P62069 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp46P62069 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp46P62069 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp46P62069 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp46P62069 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp46P62069 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp46P62069 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp46P62069 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp46P62069 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp46P62069 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp46P62069 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp46P62069 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp46P62069 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms