Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufm1P61961 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufm1P61961 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufm1P61961 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufm1P61961 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms